Ο πατέρας Αντώνιος και ακόμη 4 κατηγορούμενοι κρίθηκαν ομόφωνα ένοχοι για τις καταγγελίες για σωματική κακοποίηση, τιμωρίες και καψόνια σε ανήλικους τροφίμους των δομών της Κιβωτού του Κόσμου.
Ο πρώην ιδρυτής της ΜΚΟ καταδικάστηκε για πέντε πράξεις πλημμεληματικού χαρακτήρα. Για επιμέρους πράξεις καταδικάστηκαν και οι υπόλοιποι τέσσερις κατηγορούμενοι πρώην εργαζόμενοι του Οργανισμού. Οι υπόλοιποι τρεις κατηγορούμενοι κρίθηκαν αθώοι.
Με την απόφαση του, το δικαστήριο δέχθηκε ως αληθείς καταγγελίες τροφίμων, οι οποίοι μιλούσαν για εξαντλητική εργασία, παρατεταμένη απομόνωση για σωφρονισμό, ακόμα και για ξυλοδαρμούς. Αναγνωρίζει ακόμη την ηθική αυτουργία του πατέρα Αντώνιου.
Την ενοχή του πατέρα Αντώνιου για πέντε από τις πράξεις που κατηγορείται σχετικά με τις κακοποιήσεις σε δομές της «Κιβωτού του Κόσμου» είχε ζητήσει η εισαγγελέας της έδρας του Τριμελούς Πλημμελειοδικείου της Αθήνας.
«Ήταν ιδρυτής της Κιβωτού, ήταν πνευματικός καθοδηγητής. Το μοντέλο λειτουργίας ήταν δικής του έμπνευσης. Παρά τον ισχυρισμό του ότι είχε πνευματικό ρόλο, συνάγεται ότι είχε ενεργό και κυρίαρχο ρόλο» είχε σημειώσει η εισαγγελέας αποδίδοντας του γνώση των ενεργειών των υφιστάμενων του.
«Ο πρώτος κατηγορούμενος είχε γνώση των ενεργειών που έλαβαν χώρα και δεν ήταν αμέτοχος. Τα δυο περιστατικά έλαβαν χώρα σε χώρο και χρόνο που ήταν παρών στη δομή. Αποδείχθηκε η ηθική αυτουργία στην επικίνδυνη σωματική βλάβη και την απλή σωματική βλάβη κατά συρροή»